Ubicada en el condado de Clarke, Stone's Chapel se remonta a finales de la década 1700194, cuando el área aún era parte del condado de Frederick. Comenzando con una iglesia de madera anterior, ahora desaparecida, Stone's Chapel ha sido el hogar de feligreses de habla alemana e inglesa atendidos por ministros luteranos, reformados alemanes y presbiterianos. El edificio actual de ladrillo fue construido en 1848, probablemente en un estilo vernáculo del renacimiento griego, por una comunidad multidenominacional. A finales de la década de 1800, las congregaciones luteranas, reformadas alemanas y presbiterianas, los principales grupos protestantes que dominaban en el valle de Shenandoah en Virginia, compartían la iglesia. Por lo tanto, el cementerio y la iglesia reflejan la herencia de los colonos alemanes y escoceses-irlandeses que se mudaron a la parte noroeste de Clarke desde Maryland y Pensilvania después del final de la Revolución Americana. El edificio también evoca la historia temprana de Virginia, cuando las denominaciones protestantes menos prósperas tuvieron que unir sus recursos para construir y mantener iglesias y cementerios. En 1886, se estableció la Iglesia Presbiteriana de Stone's Chapel y la congregación reformada alemana se disolvió, al igual que la congregación luterana en 1899. Para 1905, la mejora de la condición financiera de la iglesia y sus feligreses resultó en la adición de una sala sabática y una torre de vestíbulo, y la instalación de vitrales conmemorativos en el santuario. Los entierros marcados más antiguos en el cementerio de Stone's Chapel datan de 1816.